от компании (организации): ООО БОСТОНДЖИН в городе (населённом пункте): Москва, Россия
в отрасли экономики "Наука, образование" → "Биотехнологии"
с заработной платой: по договоренности
Вакансия № 18391720 добавлена в базу данных сайта Работа в Москве и Московской области (МО, Подмосковье): Суббота, 31 августа 2024 года.
Дата обновления вакансии № 18391720 на сайте Работа в Москве и Московской области (МО, Подмосковье): Вторник, 24 сентября 2024 года.
Обращаем Ваше внимание, что на момент обращения к работодателю вакансия № 18391720 может быть уже занята. Администрация сайта Работа в Москве и Московской области (МО, Подмосковье) приносит извинения за доставленные неудобства.
Требования к опыту работы:
1–3 года
Тип занятости:
полная занятость
График работы:
гибкий график
Дополнительные сведения о вакансии: Bioinformatics Software Engineer – Genomics
BostonGene разрабатывает облачную платформу для онкологов, которая помогает подбирать противоопухолевые терапии для пациентов, основываясь на NGS анализе опухоли. От того, насколько чувствителен и точен наш анализ зависит жизнь пациента.
В лаборатории BostonGene в Бостоне мы разрабатываем, тестируем и валидируем новые протоколы для проведения теста, а также наши биоинформатические алгоритмы для анализа генетических данных. В 2020 году мы успешно прошли сертификацию CLIA (Clinical Laboratory Improvement Amendments, https://www.cms.gov/Regulations-and-Guidance/Legislation/CLIA) и теперь работаем с клиническим материалом пациентов для проведения секвенирования и последующего анализа в своей лаборатории. До этого мы имели более 4 лет опыта работы с данными коллабораторов из ведущих Американских научных центров и большими массивами открытых данных.
Задачи:
- Улучшение, поддержка существующих pipeline и рабочих процессов секвенирования ДНК, соответствующие рекомендациям CLIA и CAP (https://www.cap.org/laboratory-improvement/accreditation) для клинического анализа NGS;
- Разработка и проведение анализа для улучшения систем поиска вариантов (germline/somatic), классификации и анализа;
- Постоянное улучшение и обслуживание существующих pipeline;
- Разработка алгоритмов, используемых для понимания вариабельности рака посредством анализа данных NGS (WES/WGS), оценка и интеграция сторонних инструментов;
- Анализ больших данных по сотням и тысячам образцов для оценки точности и производительности алгоритмов коллинга мутаций;
- Непосредственное взаимодействие с лабораторией для оптимизации и валидации теста;
- Общение с внешними научными командами;
- Сотрудничество с учеными и клиницистами в разработке и проведении анализа данных клинического секвенирования опухоли с целью повышения качества лечения.
Навыки:
- Знание английского не ниже Intermediate;
- Детальное мышление для работы с приложениями, которые напрямую влияют на здоровье реальных пациентов;
- Опыт в использовании version control and source code management systems (e.g. Git);
- Опыт работы в области моногенных заболеваний, генетики рака, иммунологии и молекулярной биологии;
- Опыт работы с данными NGS;
- Свободное владение Python/R, BASH;
- Самостоятельно и хорошо работает в междисциплинарных командах (не значит, что мы вас бросим, но прописывать каждый шаг в задаче мы не будем; многие анализы являются уникальными и опыта их исследования в мире нет).
Будет плюсом:
- Amazon AWS;
- CI / CD;
- Docker или другая контейнеризация / виртуализация
- Опыт использования workflow менеджеров, напрмер airflow, luigi, nextflow/Arvados;
- Опыт программирования на C ++ / Java будет плюсом.
Мы предлагаем:
- Опыт работы в отрасли precision medicine;
- Гибкий рабочий график, возможность работать как в офисе, так и удаленно;
- Коллектив из выпускников лучших ВУЗов (МФТИ, МГУ, Первый мед, СколТех);
- Регулярный пересмотр оклада, ДМС, корпоративные скидки;
- Интересная работа и сложные задачи;
- Офис в пешей доступности от станции метро Павелецкая (сейчас на удаленном формате работы находится большая часть компании)
Откликнуться на эту вакансию: Bioinformatics Software Engineer – Genomics
Предыдущая вакансия:
Вакансия № 18391719 на должность Эксперт SAP MM от компании Selecty в городе (населенном пункте) Москва